人気アニメの劇場版。遠い未来、人類は地中深くで生活していた。ある日、ジーハ村に暮らす内気な少年シモンと、地上の世界があることを信じて疑わない男カミナのもとに、崩れ落ちた天井からヨーコという少女が落ちてきて……。