ジェリコに幽閉され、日に日に衰弱していくジョン。過酷な状況下で生き抜くことはできるのか─。一方、適合者の偵察部隊はエイリアンの新たな情報を入手する。さらなる謎を明らかにするために行う、危険な任務とは─!?
安全と思われたジェリコ内で凄惨な光景を目の当たりにし、逃亡するジョン。だが直後、エイリアンに遭遇してしまう。絶体絶命の場面で彼の前に現われたのは!?
空からやってきたエイリアンに支配された星。生きる希望を失った男・ジョンは残された生存者達と一縷の望みをかけ謎の信号の発信源へ向かうが──…