物語はゲームの時間軸の少し前からスタート。都会から稲羽市に転校してきた陽介は田舎生活に悩みながらすごしていた。そんななか鳴上悠が転校してきた頃から日常が変わりはじめる。
連続殺人事件の犯人を逮捕へと導いた総司たち。総司の家で手作りの料理で打ち上げをするが、そこで再び林間学校の悪夢がよみがえるのだったーー。