2006年6月発売
▼第1話／夕食の献立▼第2話／夢見るスター▼第3話／探偵団の雪ダルマ▼第4話／転落の軌跡▼第5話／破局の雪山▼第6話／人を飲む部屋▼第7話／幻の死体▼第8話／血痕のカラクリ▼第9話／東の高校生探偵▼第10話／探偵甲子園▼第11話／密室証明 ●主な登場人物／江戸川コナン（見かけは小学生だが、その正体は「黒の組織」に毒薬を飲まされて体が小さくなった高校生名探偵・工藤新一）、毛利蘭（新一の幼なじみ。帝丹高校2年）、毛利小五郎（蘭の父親で探偵。コナンのおかげで“眠りの小五郎”として有名に） ●あらすじ／本堂瑛祐が見つけた不可解な事件を調べている最中、別の殺人事件を追う高木刑事らと遭遇したコナンたち。早速現場に向かったところ、被害者の女性・船本兼世の子どもは、“水無怜奈”の事故現場を目撃したのと同じ少年だった！ 本堂と黒の組織との関係にコナンが疑いを深める中、目黒警部や小五郎らによる事故の検証は進んでいくが…（第1話）。 ●本巻の特徴／黒の組織の影が見え隠れする主婦殺人事件（第1〜2話）。卒業を控えた美大生の雪山殺人事件（第3〜5話）。お寺の一室で忽然と消えた幻の死体事件（第7〜8話）に続き、第9話からは東西南北の高校生探偵を集めたTVの企画「探偵甲子園」が開幕！ 舞台となる無人島に向かう船には、果たしてどんな面々が…!? ●その他の登場人物／本堂瑛祐（蘭のクラスの転校生。一見ドジだが、黒ずくめの女・水無怜奈と何らかの関係が？）、小嶋元太・吉田歩美・円谷光彦（コナンの同級生たち。少年探偵団を結成）、灰原哀（新一が飲まされた毒薬の開発者だが、自らも薬を飲んで「黒の組織」から逃亡。阿笠の家に居候中）、服部平次（関西の高校生探偵。新一のライバル）、遠山和葉（平次のガールフレンド。蘭とは仲良し）
▼第1話／ルールの落とし穴▼第2話／序盤の攻防▼第3話／動き出した試合▼第4話／遅れてきたルーキー▼第5話／呪縛▼第6話／冷静沈着▼第7話／つながれた想い▼第8話／想いをのせた一打▼第9話／熱戦の果てに▼第10話／その正体は ●主な登場人物／茂野吾郎（高校卒業後、日本をとび出し、アメリカ3Aのバッツに入団し、抑え投手として活躍。160キロのストレートが武器の日本代表投手）、佐藤寿也（吾郎の幼なじみで、初めての野球友達。巨仁で新人王を獲得し、日本代表に追加招集された） ●あらすじ／吾郎の応援のため、アメリカに来ていた薫は、寿也のファンだという謎の日本人少女に出会う。一方、日本代表は野球W杯決勝トーナメント進出のために、2次リーグ最終戦・ドミニカ戦に負けられない状況となっていた。そんな中、三連投禁止の大会規定で登板できない吾郎は、チームメートに望みを託すしかなく…（第1話）。 ●本巻の特徴／野球W杯2次リーグ・日本vsドミニカ戦。メジャーリーガーを揃えたスター軍団を相手に、序盤は両者譲らぬ投手戦。だが、6回にドミニカ打線が爆発し一挙4失点！ 日本はルーキー・眉村の登板をきっかけに、スモールベースボールで反撃なるか…!? ●その他の登場人物／眉村（海堂高校時代のエースで吾郎のライバル。ルーキーで唯一、最初から日本代表に選ばれた）、大木（野球W杯の日本代表監督）、茂野英毅（吾郎の父親で元プロ投手。日本代表の投手コーチ）、コジロー・松尾（アメリカで活躍する日本人メジャーリーガーたち）、清水薫（ソフトボール部に所属する女子大生。吾郎の幼なじみで恋人に）
