2006年9月15日発売
▼第1話／探偵たちの名推理▼第2話／熱血探偵▼第3話／元太のシュート▼第4話／元太とエル▼第5話／イタズラ坊主▼第6話／月下▼第7話／黎明▼第8話／白昼▼第9話／落日▼第10話／秘密の妃英理（1）▼第11話／秘密の妃英理（2）●主な登場人物／江戸川コナン（見かけは小学生だが、その正体は「黒の組織」に毒薬を飲まされて体が小さくなった高校生名探偵・工藤新一）、毛利蘭（新一の幼なじみ。帝丹高校2年）、毛利小五郎（蘭の父親で探偵。コナンのおかげで“眠りの小五郎”として有名に）●あらすじ／TV企画「探偵甲子園」の出場者のひとり、北の高校生探偵・時津が密室で殺された。ずっとダイニングで一緒にいたコナン・服部・白馬の3人は、アリバイがない他の3人のいずれかが犯人と考え、彼らを別室に隔離して現場の捜査を開始する。だがその結果、コナン・服部・白馬が導き出した犯人は、なんと全員バラバラで…!?（第1話）●本巻の特徴／前巻に続きTV企画「探偵甲子園」での無人島密室殺人事件（第1〜2話）。犯人は元太!? 駐車場で起きた強盗傷害事件（第3〜5話）。10年前の新一と蘭が登場する、思い出の謎解きエピソード（第6〜9話）。蘭の母・英理に浮気疑惑が…!?（第10〜11話）●その他の登場人物／小嶋元太・吉田歩美・円谷光彦（コナンの同級生たち。少年探偵団を結成）、灰原哀（新一が飲まされた毒薬の開発者だが、自らも薬を飲んで「黒の組織」から逃亡。阿笠の家に居候中）、服部平次（関西の高校生探偵。新一のライバル）、遠山和葉（平次のガールフレンド。蘭とは仲良し）、白馬探（警視総監の息子で、怪盗キッドを捕まえようとしている）、妃英理（蘭の母で敏腕弁護士。夫・小五郎とは別居中）、工藤有希子（新一の母。元女優）、工藤優作（新一の父。世界的な推理小説家）
▼第116話／ズレ▼第117話／忠告▼第118話／真の力▼第119話／脱出▼第120話／帰路▼第121話／ビンタ▼第122話／来訪者▼第123話／キヨコ▼第124話／釘▼第125話／師匠と弟子 ●主な登場人物／墨村良守（結界師・墨村家の22代目正統継承者。14歳。時音を守るために強くなろうと決意）、雪村時音（良守の隣家に住む結界師一族の娘。16歳。家同士は犬猿の仲） ●あらすじ／ついに火黒と対峙した良守。徐々にパワーが増す火黒に対し、良守は通常とは異なる結界を発動して応戦する。だが、刀をへし折られても火黒の余裕の態度は変わらず、「その術は完成の域に達していない」と言い放つ。そして昔、もっと完成された技を見たことがあるとも…。それは、領域に踏みこんだ者を跡形なく消し去ってしまう“絶界”と呼ばれる術らしく…（第116話）。 ●本巻の特徴／圧倒的な戦闘能力を誇る火黒！ そして目覚め始めた良守の新たなる力・絶界！ 果たして死闘の結末は…？ 黒芒楼編、ここに完結!! ●その他の登場人物／火黒（黒芒楼の強力な妖。良守の仲間・志々尾限を刃にかけた ）、白（烏森を狙う妖たちの組織「黒芒楼」の幹部。左眼に蟲を飼う）、影宮閃（裏会・実行部隊「夜行」の一員。能力は妖混じり）、墨村正守（良守の兄。裏会の幹部組織・十二人会のメンバーであり、夜行の頭領）、墨村繁守（良守の祖父。墨村家21代目当主の結界師）
